Como parte de las actividades tendientes a incrementar la generación de recursos propios y a fortalecer la vinculación de las actividades de investigación y desarrollo con los temas de interés para la sociedad y el sector productivo, el Instituto comercializa regularmente una serie de productos y servicios con usuarios externos, derivados de las diversas instalaciones, laboratorios y de las Capacidades Tecnológicas que ha logrado acumular a lo largo del tiempo.

Algunos de los productos que comercializa el ININ son elaborados en la Planta de Producción de Radiofármacos y Radioisótopos, dependiente del Departamento de Material Radiactivo de la Gerencia de Aplicaciones Nucleares en la Salud. La Planta es la única en su tipo que existe en el país, cuenta con Licencia Sanitaria y Certificado de Buenas Prácticas de Fabricación, emitidos por la Secretaría de Salud, y licencias para el manejo y la transportación de material radiactivo, expedidas por la Comisión Nacional de Seguridad Nuclear y Salvaguardias. Asimismo, el sistema de calidad de la Planta se encuentra certificado bajo la Norma ISO 9001:2000.

Uno de los servicios que presta el ININ es la irradiación de productos. El servicio es proporcionado por la Planta de Irradiación Gamma, adscrita al Departamento del Irradiador Gamma de la Gerencia de Ingeniería. La Planta inició operaciones hace 25 años y con este proyecto el Instituto se encargó de difundir la técnica de irradiación gamma y de desarrollar un mercado de irradiación de productos en el país, manteniéndose como el único prestador de este servicio en forma comercial hasta el año 2000. Dispone de un irradiador industrial Nordion modelo JS-6500, de manufactura canadiense, cuenta con Licencia Sanitaria emitida por la Secretaría de Salud y licencia para la operación de instalaciones radiactivas expedida por la Comisión Nacional de Seguridad Nuclear y Salvaguardias (CNSNS). El sistema de calidad de la Planta se encuentra certificado bajo la Norma ISO 9001:2000 y los estándares de operación, calidad y transparencia del servicio cumplieron con los requisitos establecidos por la Secretaría de la Función Pública para formalizar la Carta Compromiso al Ciudadano correspondiente a los servicios de irradiación gamma del ININ.